How To Draw Hydrogen Bonding
论绘氢键之法
欲绘氢键,首明其理。氢键者,非化学键,乃分子间或分子内特殊之相互作用。其成也,必具含氢之极性分子,氢连于电负性大、半径小之原子,如氮、氧、氟,此氢遂具强正电性,可与他分子中电负性大之原子以弱力相吸,是为氢键。
绘之之时,先确含氢键之分子结构。以水为例,水分子中氢连于氧,氧电负性大,氢显正电。绘水分子,氧居中心,氢分居两侧,以实线段表氢氧共价键。
继而示氢键。于相邻水分子间,以虚线连一水分子之氢与他水分子之氧,此虚线即表氢键。注意氢键之向,必自氢指向电负性大之原子。
若绘复杂体系,如蛋白质或核酸中氢键,亦循此理。先详绘分子骨架,标清各原子位置,尤其含氢及具大电负性之原子。再依氢键形成规则,以虚线连相关原子,清晰展示氢键网络。
绘氢键,关键在准,结构当明,氢键向、位必确,如此方可准确呈现分子间此特殊相互作用,以助于对物质性质与结构之研习。
欲绘氢键,首明其理。氢键者,非化学键,乃分子间或分子内特殊之相互作用。其成也,必具含氢之极性分子,氢连于电负性大、半径小之原子,如氮、氧、氟,此氢遂具强正电性,可与他分子中电负性大之原子以弱力相吸,是为氢键。
绘之之时,先确含氢键之分子结构。以水为例,水分子中氢连于氧,氧电负性大,氢显正电。绘水分子,氧居中心,氢分居两侧,以实线段表氢氧共价键。
继而示氢键。于相邻水分子间,以虚线连一水分子之氢与他水分子之氧,此虚线即表氢键。注意氢键之向,必自氢指向电负性大之原子。
若绘复杂体系,如蛋白质或核酸中氢键,亦循此理。先详绘分子骨架,标清各原子位置,尤其含氢及具大电负性之原子。再依氢键形成规则,以虚线连相关原子,清晰展示氢键网络。
绘氢键,关键在准,结构当明,氢键向、位必确,如此方可准确呈现分子间此特殊相互作用,以助于对物质性质与结构之研习。
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